Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL18Q07020 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms