Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN11Q06124 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms