Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ERCC6Q03468 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
ERCC6Q03468 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
ERCC6Q03468 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
ERCC6Q03468 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
ERCC6Q03468 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
ERCC6Q03468 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
ERCC6Q03468 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6Q03468 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6Q03468 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6Q03468 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6Q03468 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6Q03468 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6Q03468 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6Q03468 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ERCC6Q03468 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ERCC6Q03468 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ERCC6Q03468 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
ERCC6Q03468 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ERCC6Q03468 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ERCC6Q03468 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ERCC6Q03468 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ERCC6Q03468 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ERCC6Q03468 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ERCC6Q03468 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ERCC6Q03468 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
ERCC6Q03468 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ERCC6Q03468 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
ERCC6Q03468 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ERCC6Q03468 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC40.02■■■■■ 4
ERCC6Q03468 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC40.02■■■■■ 4
ERCC6Q03468 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
ERCC6Q03468 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
ERCC6Q03468 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC40.02■■■■■ 4
ERCC6Q03468 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ERCC6Q03468 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ERCC6Q03468 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC40.01■■■■■ 4
ERCC6Q03468 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
ERCC6Q03468 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
ERCC6Q03468 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ERCC6Q03468 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ERCC6Q03468 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms