Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NUCB1Q02818 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUCB1Q02818 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms