Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB1Q02641 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms