Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN2Q02246 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms