Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPEQ02224 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms