Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN7AQ01118 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms