Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIM1P81133 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIM1P81133 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIM1P81133 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIM1P81133 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIM1P81133 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIM1P81133 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIM1P81133 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIM1P81133 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIM1P81133 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIM1P81133 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIM1P81133 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIM1P81133 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIM1P81133 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIM1P81133 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIM1P81133 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIM1P81133 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIM1P81133 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIM1P81133 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SIM1P81133 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIM1P81133 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIM1P81133 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIM1P81133 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIM1P81133 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIM1P81133 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIM1P81133 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIM1P81133 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIM1P81133 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIM1P81133 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIM1P81133 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIM1P81133 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIM1P81133 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIM1P81133 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIM1P81133 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIM1P81133 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIM1P81133 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIM1P81133 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIM1P81133 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIM1P81133 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIM1P81133 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIM1P81133 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIM1P81133 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIM1P81133 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIM1P81133 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIM1P81133 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIM1P81133 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIM1P81133 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIM1P81133 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIM1P81133 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIM1P81133 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIM1P81133 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIM1P81133 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIM1P81133 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIM1P81133 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIM1P81133 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIM1P81133 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIM1P81133 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIM1P81133 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIM1P81133 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIM1P81133 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIM1P81133 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIM1P81133 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIM1P81133 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIM1P81133 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIM1P81133 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms