Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA4AP68366 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TUBA4AP68366 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA4AP68366 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA4AP68366 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA4AP68366 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA4AP68366 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBA4AP68366 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA4AP68366 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA4AP68366 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA4AP68366 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBA4AP68366 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA4AP68366 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBA4AP68366 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA4AP68366 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA4AP68366 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA4AP68366 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA4AP68366 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA4AP68366 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA4AP68366 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA4AP68366 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA4AP68366 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBA4AP68366 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA4AP68366 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA4AP68366 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA4AP68366 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA4AP68366 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA4AP68366 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA4AP68366 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA4AP68366 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBA4AP68366 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA4AP68366 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA4AP68366 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA4AP68366 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA4AP68366 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA4AP68366 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms