Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCALDP61601 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCALDP61601 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCALDP61601 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCALDP61601 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCALDP61601 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCALDP61601 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCALDP61601 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCALDP61601 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCALDP61601 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCALDP61601 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCALDP61601 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCALDP61601 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCALDP61601 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCALDP61601 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCALDP61601 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCALDP61601 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCALDP61601 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCALDP61601 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCALDP61601 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCALDP61601 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCALDP61601 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCALDP61601 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCALDP61601 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCALDP61601 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCALDP61601 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCALDP61601 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCALDP61601 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCALDP61601 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCALDP61601 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCALDP61601 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCALDP61601 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCALDP61601 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCALDP61601 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCALDP61601 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCALDP61601 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCALDP61601 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCALDP61601 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCALDP61601 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCALDP61601 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCALDP61601 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCALDP61601 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCALDP61601 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCALDP61601 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCALDP61601 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCALDP61601 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCALDP61601 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCALDP61601 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCALDP61601 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCALDP61601 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCALDP61601 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms