Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMA6P60900 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA6P60900 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms