Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCCD1P59942 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms