Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB25P57735 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB25P57735 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB25P57735 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB25P57735 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB25P57735 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB25P57735 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB25P57735 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB25P57735 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB25P57735 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB25P57735 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB25P57735 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB25P57735 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB25P57735 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB25P57735 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB25P57735 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB25P57735 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB25P57735 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB25P57735 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB25P57735 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB25P57735 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB25P57735 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB25P57735 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB25P57735 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB25P57735 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB25P57735 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB25P57735 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB25P57735 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB25P57735 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB25P57735 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB25P57735 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB25P57735 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB25P57735 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB25P57735 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB25P57735 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB25P57735 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB25P57735 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB25P57735 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB25P57735 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB25P57735 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB25P57735 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB25P57735 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB25P57735 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB25P57735 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB25P57735 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB25P57735 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB25P57735 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB25P57735 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB25P57735 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB25P57735 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB25P57735 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB25P57735 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB25P57735 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB25P57735 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB25P57735 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB25P57735 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB25P57735 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB25P57735 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB25P57735 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB25P57735 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB25P57735 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB25P57735 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB25P57735 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB25P57735 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB25P57735 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms