Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL23P55773 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL23P55773 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL23P55773 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL23P55773 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL23P55773 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL23P55773 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL23P55773 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL23P55773 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL23P55773 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL23P55773 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL23P55773 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL23P55773 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL23P55773 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCL23P55773 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL23P55773 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL23P55773 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL23P55773 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL23P55773 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL23P55773 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL23P55773 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL23P55773 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL23P55773 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL23P55773 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL23P55773 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL23P55773 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL23P55773 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL23P55773 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL23P55773 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL23P55773 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL23P55773 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL23P55773 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL23P55773 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL23P55773 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL23P55773 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL23P55773 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL23P55773 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL23P55773 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL23P55773 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL23P55773 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL23P55773 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL23P55773 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL23P55773 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL23P55773 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL23P55773 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL23P55773 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCL23P55773 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCL23P55773 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL23P55773 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL23P55773 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL23P55773 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL23P55773 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL23P55773 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL23P55773 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL23P55773 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL23P55773 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL23P55773 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL23P55773 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL23P55773 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL23P55773 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL23P55773 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL23P55773 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL23P55773 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL23P55773 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL23P55773 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms