Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP6P55212 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP6P55212 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP6P55212 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP6P55212 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP6P55212 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP6P55212 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP6P55212 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP6P55212 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP6P55212 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP6P55212 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP6P55212 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP6P55212 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP6P55212 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP6P55212 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP6P55212 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP6P55212 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP6P55212 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP6P55212 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP6P55212 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP6P55212 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP6P55212 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP6P55212 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP6P55212 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP6P55212 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP6P55212 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP6P55212 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP6P55212 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP6P55212 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP6P55212 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP6P55212 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP6P55212 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP6P55212 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP6P55212 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP6P55212 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP6P55212 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP6P55212 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP6P55212 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP6P55212 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP6P55212 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP6P55212 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP6P55212 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP6P55212 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP6P55212 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP6P55212 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP6P55212 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP6P55212 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP6P55212 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP6P55212 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms