Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFAP3P55082 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFAP3P55082 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFAP3P55082 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFAP3P55082 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFAP3P55082 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFAP3P55082 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFAP3P55082 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFAP3P55082 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFAP3P55082 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFAP3P55082 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFAP3P55082 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms