Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA4P54764 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms