Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHB3P54753 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms