Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms