Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGGTBP53611 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
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