Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KPNA1P52294 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KPNA1P52294 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KPNA1P52294 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms