Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNHP51946 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNHP51946 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNHP51946 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNHP51946 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNHP51946 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNHP51946 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNHP51946 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNHP51946 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNHP51946 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNHP51946 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNHP51946 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNHP51946 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNHP51946 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNHP51946 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNHP51946 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNHP51946 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNHP51946 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNHP51946 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNHP51946 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNHP51946 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNHP51946 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNHP51946 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNHP51946 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNHP51946 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNHP51946 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNHP51946 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNHP51946 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNHP51946 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNHP51946 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNHP51946 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNHP51946 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNHP51946 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNHP51946 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNHP51946 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNHP51946 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNHP51946 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNHP51946 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNHP51946 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNHP51946 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNHP51946 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNHP51946 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNHP51946 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNHP51946 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNHP51946 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNHP51946 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNHP51946 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNHP51946 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNHP51946 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNHP51946 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNHP51946 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNHP51946 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNHP51946 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNHP51946 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNHP51946 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNHP51946 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNHP51946 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNHP51946 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNHP51946 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNHP51946 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNHP51946 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNHP51946 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNHP51946 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNHP51946 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNHP51946 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNHP51946 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNHP51946 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNHP51946 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNHP51946 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNHP51946 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNHP51946 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNHP51946 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNHP51946 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.6 ms