Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN3P51790 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms