Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR8P51685 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR8P51685 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR8P51685 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR8P51685 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR8P51685 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR8P51685 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR8P51685 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR8P51685 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR8P51685 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR8P51685 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR8P51685 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCR8P51685 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR8P51685 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR8P51685 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCR8P51685 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCR8P51685 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCR8P51685 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms