Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GATMP50440 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GATMP50440 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GATMP50440 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GATMP50440 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GATMP50440 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GATMP50440 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATMP50440 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATMP50440 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATMP50440 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATMP50440 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GATMP50440 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GATMP50440 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GATMP50440 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATMP50440 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATMP50440 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATMP50440 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATMP50440 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATMP50440 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATMP50440 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATMP50440 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATMP50440 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATMP50440 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATMP50440 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATMP50440 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GATMP50440 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GATMP50440 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GATMP50440 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GATMP50440 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GATMP50440 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GATMP50440 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATMP50440 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GATMP50440 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATMP50440 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATMP50440 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATMP50440 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATMP50440 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GATMP50440 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATMP50440 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATMP50440 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATMP50440 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATMP50440 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATMP50440 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATMP50440 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATMP50440 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATMP50440 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GATMP50440 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATMP50440 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATMP50440 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GATMP50440 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATMP50440 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATMP50440 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATMP50440 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATMP50440 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATMP50440 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATMP50440 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GATMP50440 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATMP50440 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATMP50440 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATMP50440 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATMP50440 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATMP50440 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATMP50440 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATMP50440 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATMP50440 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATMP50440 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATMP50440 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATMP50440 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATMP50440 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATMP50440 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATMP50440 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATMP50440 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATMP50440 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATMP50440 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATMP50440 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATMP50440 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms