Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms