Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms