Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRP9P49458 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRP9P49458 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRP9P49458 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRP9P49458 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRP9P49458 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRP9P49458 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRP9P49458 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRP9P49458 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRP9P49458 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRP9P49458 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRP9P49458 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP9P49458 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP9P49458 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP9P49458 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP9P49458 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP9P49458 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP9P49458 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP9P49458 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP9P49458 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP9P49458 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP9P49458 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP9P49458 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRP9P49458 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP9P49458 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP9P49458 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP9P49458 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP9P49458 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP9P49458 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP9P49458 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP9P49458 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP9P49458 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP9P49458 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP9P49458 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP9P49458 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP9P49458 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP9P49458 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP9P49458 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP9P49458 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP9P49458 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP9P49458 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP9P49458 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP9P49458 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP9P49458 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP9P49458 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP9P49458 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP9P49458 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP9P49458 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP9P49458 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP9P49458 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP9P49458 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP9P49458 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP9P49458 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP9P49458 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP9P49458 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP9P49458 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP9P49458 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP9P49458 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP9P49458 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP9P49458 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP9P49458 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP9P49458 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP9P49458 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP9P49458 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP9P49458 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP9P49458 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP9P49458 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP9P49458 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP9P49458 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms