Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN1P49257 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms