Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
TNNI2P48788 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms