Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms