Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A9P48067 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms