Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AFMP43652 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFMP43652 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AFMP43652 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AFMP43652 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AFMP43652 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AFMP43652 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AFMP43652 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AFMP43652 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AFMP43652 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AFMP43652 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AFMP43652 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AFMP43652 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AFMP43652 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AFMP43652 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AFMP43652 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AFMP43652 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AFMP43652 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AFMP43652 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AFMP43652 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AFMP43652 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AFMP43652 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AFMP43652 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AFMP43652 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AFMP43652 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AFMP43652 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AFMP43652 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AFMP43652 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AFMP43652 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AFMP43652 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AFMP43652 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AFMP43652 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AFMP43652 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AFMP43652 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AFMP43652 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AFMP43652 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFMP43652 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFMP43652 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFMP43652 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFMP43652 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFMP43652 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFMP43652 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFMP43652 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFMP43652 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFMP43652 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFMP43652 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFMP43652 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFMP43652 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFMP43652 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFMP43652 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
AFMP43652 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFMP43652 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFMP43652 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFMP43652 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFMP43652 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AFMP43652 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFMP43652 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AFMP43652 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFMP43652 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFMP43652 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFMP43652 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFMP43652 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFMP43652 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFMP43652 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFMP43652 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFMP43652 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFMP43652 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFMP43652 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AFMP43652 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFMP43652 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms