Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGIRP43119 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms