Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms