Protein–RNA interactions for Protein: P41968

MC3R, Melanocortin receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC3RP41968 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC3RP41968 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC3RP41968 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC3RP41968 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC3RP41968 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC3RP41968 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC3RP41968 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC3RP41968 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC3RP41968 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC3RP41968 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC3RP41968 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC3RP41968 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC3RP41968 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MC3RP41968 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MC3RP41968 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC3RP41968 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC3RP41968 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC3RP41968 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MC3RP41968 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC3RP41968 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC3RP41968 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC3RP41968 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC3RP41968 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC3RP41968 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC3RP41968 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC3RP41968 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC3RP41968 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MC3RP41968 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC3RP41968 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC3RP41968 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC3RP41968 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC3RP41968 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC3RP41968 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC3RP41968 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC3RP41968 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC3RP41968 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC3RP41968 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC3RP41968 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MC3RP41968 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC3RP41968 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC3RP41968 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC3RP41968 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC3RP41968 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC3RP41968 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC3RP41968 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC3RP41968 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC3RP41968 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC3RP41968 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC3RP41968 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC3RP41968 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC3RP41968 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC3RP41968 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC3RP41968 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MC3RP41968 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MC3RP41968 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms