Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms