Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MLH1P40692 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MLH1P40692 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MLH1P40692 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MLH1P40692 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MLH1P40692 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MLH1P40692 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MLH1P40692 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MLH1P40692 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MLH1P40692 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MLH1P40692 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MLH1P40692 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MLH1P40692 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MLH1P40692 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MLH1P40692 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MLH1P40692 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MLH1P40692 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MLH1P40692 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MLH1P40692 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MLH1P40692 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MLH1P40692 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MLH1P40692 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MLH1P40692 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MLH1P40692 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MLH1P40692 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MLH1P40692 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MLH1P40692 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MLH1P40692 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MLH1P40692 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MLH1P40692 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MLH1P40692 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MLH1P40692 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MLH1P40692 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MLH1P40692 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MLH1P40692 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MLH1P40692 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MLH1P40692 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MLH1P40692 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MLH1P40692 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MLH1P40692 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MLH1P40692 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH1P40692 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH1P40692 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH1P40692 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH1P40692 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH1P40692 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH1P40692 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH1P40692 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH1P40692 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH1P40692 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH1P40692 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH1P40692 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH1P40692 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH1P40692 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH1P40692 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH1P40692 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH1P40692 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH1P40692 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH1P40692 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH1P40692 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH1P40692 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH1P40692 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH1P40692 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH1P40692 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH1P40692 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH1P40692 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH1P40692 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH1P40692 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH1P40692 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH1P40692 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH1P40692 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH1P40692 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH1P40692 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH1P40692 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH1P40692 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH1P40692 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH1P40692 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH1P40692 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH1P40692 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH1P40692 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH1P40692 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH1P40692 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH1P40692 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH1P40692 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MLH1P40692 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.9 ms