Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPGP40121 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPGP40121 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPGP40121 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPGP40121 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPGP40121 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPGP40121 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPGP40121 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPGP40121 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPGP40121 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPGP40121 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPGP40121 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPGP40121 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPGP40121 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPGP40121 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPGP40121 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPGP40121 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPGP40121 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPGP40121 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPGP40121 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPGP40121 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPGP40121 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPGP40121 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPGP40121 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPGP40121 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPGP40121 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPGP40121 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPGP40121 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPGP40121 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPGP40121 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPGP40121 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPGP40121 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPGP40121 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPGP40121 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPGP40121 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPGP40121 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPGP40121 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPGP40121 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPGP40121 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPGP40121 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPGP40121 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPGP40121 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPGP40121 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPGP40121 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPGP40121 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPGP40121 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPGP40121 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPGP40121 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPGP40121 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPGP40121 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPGP40121 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPGP40121 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPGP40121 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPGP40121 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPGP40121 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPGP40121 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPGP40121 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPGP40121 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPGP40121 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPGP40121 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPGP40121 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPGP40121 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPGP40121 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPGP40121 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPGP40121 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPGP40121 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPGP40121 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPGP40121 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPGP40121 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPGP40121 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPGP40121 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPGP40121 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPGP40121 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPGP40121 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPGP40121 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms