Protein–RNA interactions for Protein: P38255

RXT2, Transcriptional regulatory protein RXT2, yeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RXT2	P38255	PRS1	YKL181W	1284 nt		5.54	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	PEX22	YAL055W	543 nt		5.54	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	MDG1	YNL173C	1101 nt		5.54	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	MET31	YPL038W	534 nt		5.54	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	SEC9	YGR009C	1956 nt		5.53	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	SPT3	YDR392W	1014 nt		5.53	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	JAC1	YGL018C	555 nt		5.53	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	ARO2	YGL148W	1131 nt		5.53	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	MAC1	YMR021C	1254 nt		5.53	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	GRX4	YER174C	735 nt		5.52	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		5.52	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	TOM40	YMR203W	1164 nt		5.52	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	YMR245W	YMR245W	621 nt		5.52	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	MRE11	YMR224C	2079 nt		5.52	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	NOP8	YOL144W	1455 nt		5.51	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	RFT1	YBL020W	1725 nt		5.51	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	CBP1	YJL209W	1965 nt		5.51	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	SLC1	YDL052C	912 nt		5.51	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	OSW5	YMR148W	447 nt		5.51	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	SFT2	YBL102W	648 nt		5.51	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	snR10	snR10	245 nt		5.51	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	ZPS1	YOL154W	750 nt		5.51	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	MET3	YJR010W	1536 nt		5.51	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	ROT2	YBR229C	2865 nt		5.51	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	MRF1	YGL143C	1242 nt		5.5	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	ECM15	YBL001C	315 nt		5.5	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	ATG33	YLR356W	594 nt		5.5	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	TRM10	YOL093W	882 nt		5.5	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	RSC6	YCR052W	1452 nt		5.5	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	DBP9	YLR276C	1785 nt		5.5	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	YAP1802	YGR241C	1707 nt		5.49	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		5.49	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	TRX2	YGR209C	315 nt		5.49	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	VPS29	YHR012W	849 nt		5.49	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	TLG2	YOL018C	1194 nt		5.49	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	FEX1	YOR390W	1128 nt		5.49	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	FEX2	YPL279C	1128 nt		5.49	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	MMR1	YLR190W	1476 nt		5.49	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	MGS1	YNL218W	1764 nt		5.48	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	RAM1	YDL090C	1296 nt		5.48	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	NOP16	YER002W	696 nt		5.48	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	GTR1	YML121W	933 nt		5.48	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	YBR016W	YBR016W	387 nt		5.48	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	RMI1	YPL024W	726 nt		5.48	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	FAP1	YNL023C	2898 nt		5.48	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	FZO1	YBR179C	2568 nt		5.48	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	MCH4	YOL119C	1506 nt		5.48	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	SED4	YCR067C	3198 nt		5.47	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	HRR25	YPL204W	1485 nt		5.47	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	FUM1	YPL262W	1467 nt		5.47	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	PEX19	YDL065C	1029 nt		5.47	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	YDR417C	YDR417C	372 nt		5.47	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	PAD1	YDR538W	729 nt		5.47	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	YNL067W-A	YNL067W-A	147 nt		5.47	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	YNL174W	YNL174W	573 nt		5.47	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	YOR292C	YOR292C	930 nt		5.47	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	GLT1	YDL171C	6438 nt		5.47	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	DOA1	YKL213C	2148 nt		5.47	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	UBA2	YDR390C	1911 nt		5.46	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	YOR1	YGR281W	4434 nt		5.46	□□□□□ -1.53
RXT2	P38255	MLF3	YNL074C	1359 nt		5.46	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	MHF2	YDL160C-A	243 nt		5.46	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	DBP8	YHR169W	1296 nt		5.46	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	NHP6A	YPR052C	282 nt		5.46	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	ECM33	YBR078W	1290 nt		5.46	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	QCR2	YPR191W	1107 nt		5.46	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	ELP2	YGR200C	2367 nt		5.46	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	IML2	YJL082W	2196 nt		5.46	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	ASA1	YPR085C	1332 nt		5.46	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	PMT2	YAL023C	2280 nt		5.45	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	YIL028W	YIL028W	399 nt		5.45	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	HPM1	YIL110W	1134 nt		5.45	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	YKR104W	YKR104W	921 nt		5.45	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	YLR296W	YLR296W	327 nt		5.45	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	ROT1	YMR200W	771 nt		5.45	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	YMR102C	YMR102C	2505 nt		5.45	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	RPN5	YDL147W	1338 nt		5.45	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	UBA1	YKL210W	3075 nt		5.44	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	AIR2	YDL175C	1035 nt		5.44	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	AAD4	YDL243C	990 nt		5.44	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	RPL28	YGL103W	450 nt		5.44	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	CAX4	YGR036C	720 nt		5.44	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	MIM2	YLR099W-A	264 nt		5.44	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	BUD22	YMR014W	1560 nt		5.44	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	LAP2	YNL045W	2016 nt		5.44	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	DCI1	YOR180C	816 nt		5.44	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	YPL199C	YPL199C	723 nt		5.44	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	UBX7	YBR273C	1311 nt		5.44	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	YBR139W	YBR139W	1527 nt		5.43	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	PMT5	YDL093W	2232 nt		5.43	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	TRS33	YOR115C	807 nt		5.43	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	GCN20	YFR009W	2259 nt		5.43	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	EXO1	YOR033C	2109 nt		5.42	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	NUP116	YMR047C	3342 nt		5.42	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	IFM1	YOL023W	2031 nt		5.42	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	CNL1	YDR357C	369 nt		5.42	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	YGR291C	YGR291C	222 nt		5.42	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	YJL193W	YJL193W	1209 nt		5.42	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	GAT3	YLR013W	426 nt		5.42	□□□□□ -1.54
RXT2	P38255	YBR298C-A	YBR298C-A	222 nt		5.42	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms