Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 FMP48YGR052W 1110 nt4.41□□□□□ -1.7
AVT5P38176 YHR022CYHR022C 771 nt4.41□□□□□ -1.7
AVT5P38176 SPO7YAL009W 780 nt4.41□□□□□ -1.7
AVT5P38176 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt4.41□□□□□ -1.7
AVT5P38176 YLL017WYLL017W 312 nt4.41□□□□□ -1.7
AVT5P38176 COG5YNL051W 1212 nt4.41□□□□□ -1.7
AVT5P38176 NOP13YNL175C 1212 nt4.41□□□□□ -1.7
AVT5P38176 ISU2YOR226C 471 nt4.41□□□□□ -1.7
AVT5P38176 RAD17YOR368W 1206 nt4.41□□□□□ -1.7
AVT5P38176 ACF2YLR144C 2340 nt4.4□□□□□ -1.7
AVT5P38176 RIM15YFL033C 5313 nt4.4□□□□□ -1.7
AVT5P38176 CLA4YNL298W 2529 nt4.4□□□□□ -1.7
AVT5P38176 PUS1YPL212C 1635 nt4.4□□□□□ -1.7
AVT5P38176 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.4□□□□□ -1.71
AVT5P38176 SNM1YDR478W 597 nt4.4□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt4.4□□□□□ -1.71
AVT5P38176 STE50YCL032W 1041 nt4.4□□□□□ -1.71
AVT5P38176 SHM1YBR263W 1473 nt4.4□□□□□ -1.71
AVT5P38176 ARN2YHL047C 1863 nt4.4□□□□□ -1.71
AVT5P38176 CLB5YPR120C 1308 nt4.4□□□□□ -1.71
AVT5P38176 GAS3YMR215W 1575 nt4.4□□□□□ -1.71
AVT5P38176 PCA1YBR295W 3651 nt4.4□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YOR1YGR281W 4434 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 BRL1YHR036W 1416 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 MSC7YHR039C 1935 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 HOT1YMR172W 2160 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 DBF2YGR092W 1719 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YDL157CYDL157C 357 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 PCT1YGR202C 1275 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 ATP12YJL180C 978 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 PGA3YML125C 939 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YGP1YNL160W 1065 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YPL113CYPL113C 1191 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 UBS1YBR165W 834 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 PEX34YCL056C 435 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YIL067CYIL067C 2037 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 FAA3YIL009W 2085 nt4.39□□□□□ -1.71
AVT5P38176 VHC1YBR235W 3363 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 MAD3YJL013C 1548 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YDR154CYDR154C 351 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 MCM21YDR318W 1107 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 LSM6YDR378C 261 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 RPL28YGL103W 450 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YOL050CYOL050C 321 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YOR024WYOR024W 324 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 PIN2YOR104W 849 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 VAM3YOR106W 852 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 GLT1YDL171C 6438 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 HRP1YOL123W 1605 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 THI20YOL055C 1656 nt4.38□□□□□ -1.71
AVT5P38176 ARB1YER036C 1833 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 ATG32YIL146C 1590 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 SDA1YGR245C 2304 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 HXT14YNL318C 1623 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 IRC7YFR055W 1023 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 SKI8YGL213C 1194 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YBL029WYBL029W 1131 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 SNO4YMR322C 714 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 PFA4YOL003C 1137 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 HSP33YOR391C 714 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 HSP32YPL280W 714 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YPR109WYPR109W 885 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YPR195CYPR195C 330 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YFL034WYFL034W 3222 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 RSC6YCR052W 1452 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 GSH2YOL049W 1476 nt4.37□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YDL241WYDL241W 372 nt4.36□□□□□ -1.71
AVT5P38176 SCS2YER120W 735 nt4.36□□□□□ -1.71
AVT5P38176 RPT6YGL048C 1218 nt4.36□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YGR011WYGR011W 327 nt4.36□□□□□ -1.71
AVT5P38176 DIA1YMR316W 1011 nt4.36□□□□□ -1.71
AVT5P38176 SPS18YNL204C 903 nt4.36□□□□□ -1.71
AVT5P38176 CAR1YPL111W 1002 nt4.36□□□□□ -1.71
AVT5P38176 UBC4YBR082C 447 nt4.36□□□□□ -1.71
AVT5P38176 DNF2YDR093W 4839 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 MNT2YGL257C 1677 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 SIS2YKR072C 1689 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YPL260WYPL260W 1656 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 SHE10YGL228W 1734 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 GDE1YPL110C 3672 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 AFT1YGL071W 2073 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YPT32YGL210W 669 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 COX3Q0275 810 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 NIT2YJL126W 924 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 MRPL4YLR439W 960 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 NFI1YOR156C 2181 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 SMP1YBR182C 1359 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 UBP7YIL156W 3216 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 MET3YJR010W 1536 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 QDR1YIL120W 1692 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 GEP3YOR205C 1671 nt4.35□□□□□ -1.71
AVT5P38176 CBP1YJL209W 1965 nt4.34□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YDL144CYDL144C 1071 nt4.34□□□□□ -1.71
AVT5P38176 YER134CYER134C 537 nt4.34□□□□□ -1.71
AVT5P38176 MNN11YJL183W 1269 nt4.34□□□□□ -1.71
AVT5P38176 PAU17YLL025W 375 nt4.34□□□□□ -1.71
AVT5P38176 ISA2YPR067W 558 nt4.34□□□□□ -1.71
AVT5P38176 DXO1YDR370C 1329 nt4.34□□□□□ -1.71
AVT5P38176 MEC3YLR288C 1425 nt4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms