Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DSG3P32926 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DSG3P32926 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DSG3P32926 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DSG3P32926 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DSG3P32926 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DSG3P32926 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DSG3P32926 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DSG3P32926 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DSG3P32926 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DSG3P32926 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DSG3P32926 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DSG3P32926 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DSG3P32926 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DSG3P32926 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG3P32926 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG3P32926 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG3P32926 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG3P32926 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG3P32926 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG3P32926 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG3P32926 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG3P32926 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG3P32926 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG3P32926 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DSG3P32926 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DSG3P32926 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG3P32926 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG3P32926 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG3P32926 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG3P32926 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG3P32926 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG3P32926 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG3P32926 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG3P32926 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DSG3P32926 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DSG3P32926 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DSG3P32926 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DSG3P32926 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DSG3P32926 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DSG3P32926 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DSG3P32926 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DSG3P32926 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DSG3P32926 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DSG3P32926 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DSG3P32926 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DSG3P32926 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DSG3P32926 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG3P32926 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG3P32926 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG3P32926 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG3P32926 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG3P32926 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG3P32926 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG3P32926 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG3P32926 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG3P32926 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG3P32926 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG3P32926 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG3P32926 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG3P32926 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG3P32926 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG3P32926 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG3P32926 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG3P32926 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG3P32926 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG3P32926 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG3P32926 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG3P32926 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG3P32926 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG3P32926 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG3P32926 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG3P32926 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG3P32926 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG3P32926 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG3P32926 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG3P32926 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG3P32926 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG3P32926 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DSG3P32926 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DSG3P32926 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DSG3P32926 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DSG3P32926 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DSG3P32926 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DSG3P32926 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DSG3P32926 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DSG3P32926 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG3P32926 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG3P32926 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG3P32926 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG3P32926 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG3P32926 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG3P32926 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG3P32926 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG3P32926 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG3P32926 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG3P32926 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG3P32926 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG3P32926 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG3P32926 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms