Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC8A1P32418 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms