Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX2P32243 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX2P32243 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX2P32243 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX2P32243 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX2P32243 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX2P32243 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX2P32243 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX2P32243 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX2P32243 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX2P32243 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX2P32243 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX2P32243 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX2P32243 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX2P32243 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX2P32243 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX2P32243 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX2P32243 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX2P32243 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX2P32243 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX2P32243 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX2P32243 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX2P32243 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX2P32243 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX2P32243 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OTX2P32243 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTX2P32243 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTX2P32243 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTX2P32243 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTX2P32243 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTX2P32243 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OTX2P32243 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTX2P32243 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTX2P32243 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTX2P32243 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTX2P32243 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTX2P32243 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTX2P32243 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTX2P32243 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTX2P32243 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTX2P32243 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTX2P32243 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTX2P32243 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTX2P32243 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTX2P32243 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTX2P32243 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTX2P32243 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTX2P32243 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTX2P32243 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTX2P32243 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms