Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD11P31277 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD11P31277 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms