Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC8P31273 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms