Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMPK1P30085 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CMPK1P30085 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms