Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1CP29017 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD1CP29017 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD1CP29017 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD1CP29017 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD1CP29017 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD1CP29017 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD1CP29017 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD1CP29017 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD1CP29017 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD1CP29017 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD1CP29017 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD1CP29017 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD1CP29017 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD1CP29017 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1CP29017 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1CP29017 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1CP29017 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1CP29017 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1CP29017 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1CP29017 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1CP29017 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1CP29017 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1CP29017 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1CP29017 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1CP29017 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD1CP29017 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD1CP29017 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD1CP29017 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD1CP29017 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD1CP29017 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD1CP29017 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD1CP29017 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD1CP29017 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD1CP29017 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1CP29017 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD1CP29017 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD1CP29017 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD1CP29017 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD1CP29017 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD1CP29017 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD1CP29017 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD1CP29017 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1CP29017 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1CP29017 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1CP29017 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1CP29017 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1CP29017 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1CP29017 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1CP29017 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1CP29017 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1CP29017 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD1CP29017 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD1CP29017 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD1CP29017 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD1CP29017 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD1CP29017 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD1CP29017 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD1CP29017 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD1CP29017 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD1CP29017 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD1CP29017 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD1CP29017 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD1CP29017 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD1CP29017 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD1CP29017 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD1CP29017 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD1CP29017 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD1CP29017 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD1CP29017 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms