Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB6P28072 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB6P28072 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms